В контекстном меню иконок программ на панели Dock есть команда Характеристики > Бросить в Dock (Options > Keep in Dock), с помощью которой можно зафиксировать определенную пиктограмму, даже если же программка выключена. То же самое можно создать, передвинув иконку программки в хоть какое пространство на «Доке». Если же же потянуть иконку за границы панели Dock, то при выключении программки эта иконка пропадет (равносильно снятию отметки у команды Бросить в Dock, либо Keep in Dock).
В своё время запустили программку, чьего ярлычка на панели Dock еще нет, ее значок возникает на «Доке» в самом конце секции ссылок на приложения.
Очевидно, в этом случае функция прикрепления программки к «Доку» остается не отмеченной в контекстном меню значка.
Ведь если значок программки просто перетащить чуток далее от текущего положения, программка автоматом сохранит свое присутствие на панели Dock.